Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms