Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim30aP15533 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms