Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irf1P15314 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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