Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb1P12658 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms