Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtcP11725 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtcP11725 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtcP11725 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtcP11725 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtcP11725 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtcP11725 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtcP11725 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtcP11725 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms