Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga5P11688 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga5P11688 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga5P11688 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms