Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DmdP11531 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DmdP11531 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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DmdP11531 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DmdP11531 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms