Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms