Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlkO54988 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms