Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dnajb6O54946 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb6O54946 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dnajb6O54946 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dnajb6O54946 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dnajb6O54946 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dnajb6O54946 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms