Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cldn5O54942 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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