Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20918J3QN17 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20918J3QN17 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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