Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21746J3QMM6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms