Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms