Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Taf4bG5E8Z2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4bG5E8Z2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms