Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vmn1r67G5E8C1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vmn1r67G5E8C1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms