Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SprtnG3X912 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SprtnG3X912 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms