Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm5160F8VPN3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5160F8VPN3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm5160F8VPN3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm5160F8VPN3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm5160F8VPN3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm5160F8VPN3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm5160F8VPN3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5160F8VPN3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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