Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp988F6VKC7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp988F6VKC7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Zfp988F6VKC7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp988F6VKC7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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