Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm340F6RGI3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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