Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Defa35E9QLQ1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms