Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms