Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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R3hdm1E9Q9Q2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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