Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pdzd2E9Q1M1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms