Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fndc1E9Q043 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms