Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ryr1E9PZQ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms