Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms