Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim12cD3Z3L3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms