Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc6D3YZP9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms