Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms