Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cttnbp2B9EJA2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms