Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clip3B9EHT4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms