Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syce3B5KM66 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms