Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Phf11bB4XVQ1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Phf11bB4XVQ1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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