Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms