Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brpf1B2RRD7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms