Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nfx1B1AY10 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms