Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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