Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms