Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms