Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms