Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf39A2RT81 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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