Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn1aA2APX8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn1aA2APX8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms