Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms