Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms