Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ambra1A2AH22 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms