Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc163A2AGD7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms