Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms