Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt27Q9Z320 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms