Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn7Q9Z261 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms